Manon Plouffe est née à Amos, mais habite aujourd'hui la région de Montréal. Elle détient un baccalauréat en études littéraires de l'Université du Québec à Montréal (1976) et un deuxième en traduction de l'Université de Montréal (1988).
En 1987, elle publie un premier livre pratique : Guide d'achats (et conseils pratiques) pour la future maman et son bébé. Elle commence par la suite un certificat en littérature jeunesse. En 1996, elle remporte le premier prix du concours de la revue Lurelu, spécialisée en littérature jeunesse, avec Casimir Mimuni.
En 1999, elle publie son premier roman jeunesse, Clara se fait les dents, suivi, l'année suivante, du Rat de bibliothèque. De 2003 à 2009, elle publie les nouvelles : Cours, Daphnée, cours!, www.mmm, Né sous une bonne étoile, La crème de la crème, Le paradis tant attendu et Roméo voit rouge dans différents collectifs pour la jeunesse et pour adultes.
En 2008, elle publie en Belgique le roman jeunesse Aventures au pays de la neige dans le cadre du 400e anniversaire de la ville de Québec.
Depuis septembre 2008, Manon Plouffe est secrétaire du conseil d'administration de l'Association des écrivains et écrivaines québécois pour la jeunesse.